Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms