Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms