Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD47Q08722 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms