Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCDQ05655 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCDQ05655 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCDQ05655 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCDQ05655 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCDQ05655 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCDQ05655 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms