Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms