Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNPO3Q9Y5L0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms