Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms