Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms