Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms