Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBFBQ13951 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBFBQ13951 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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