Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms