Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHGAP10645 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHGAP10645 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHGAP10645 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms