Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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