Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SNX13Q9Y5W8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SNX13Q9Y5W8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SNX13Q9Y5W8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SNX13Q9Y5W8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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