Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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