Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GAB3Q8WWW8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms