Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VSTM1Q6UX27 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms