Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms