Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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