Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRCC1Q9NPI7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRCC1Q9NPI7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms