Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PHF3Q92576 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PHF3Q92576 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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