Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms