Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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