Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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