Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms