Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms