Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HRCP23327 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HRCP23327 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HRCP23327 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HRCP23327 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HRCP23327 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRCP23327 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HRCP23327 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HRCP23327 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HRCP23327 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HRCP23327 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HRCP23327 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HRCP23327 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HRCP23327 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HRCP23327 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRCP23327 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms