Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F6O75461 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F6O75461 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms