Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms