Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAB39Q9Y376 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms