Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMIM3Q9BZL3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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