Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP8Q99708 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms