Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms