Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms