Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TNS3Q68CZ2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TNS3Q68CZ2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TNS3Q68CZ2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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TNS3Q68CZ2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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TNS3Q68CZ2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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TNS3Q68CZ2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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TNS3Q68CZ2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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TNS3Q68CZ2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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TNS3Q68CZ2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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TNS3Q68CZ2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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