Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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