Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CBFBQ13951 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CBFBQ13951 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CBFBQ13951 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CBFBQ13951 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CBFBQ13951 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CBFBQ13951 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CBFBQ13951 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CBFBQ13951 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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