Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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