Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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