Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PUDPQ08623 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PUDPQ08623 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms