Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB15P59190 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB15P59190 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms