Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A4D1N5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A4D1N5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A4D1N5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
A4D1N5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms