Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms