Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA5B2Q8N398 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms