Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms