Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OPN5Q6U736 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms