Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms