Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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