Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GRIK4Q16099 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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GRIK4Q16099 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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