Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TLR1Q15399 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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